Historien om byen, der oprindeligt blev kaldt Kongeriget Ny Galicien, fortsætter.
Der er også det gamle jesuitskole i Santo Tomás de Aquino, bygget i det sidste årti af det 16. århundrede, og som i 1792 blev besat af universitetet. Af konstruktionen er der kun hvad der var kirken med dens monumentale kuppel fra det sidste århundrede og det vedhæftede Loreto-kapel, bygget i 1695 af Juan María de Salvatierra. Templet San Juan de Dios, som tidligere var kapellet Santa Veracruz, bygget i det 16. århundrede af Don Pedro Gómez Maraver, blev bygget i det 18. århundrede med en barok facade med sober karakteristika. Kirken La Merced, med en barokstil, der ligner San Juan de Dios, selvom den er mere udsmykkede, blev grundlagt i det 17. århundrede af broderne Miguel Telmo og Miguel de Albuquerque.
La Soledad-templet blev bygget mod slutningen af det 17. og tidlige 18. århundrede på anmodning af Juana Romana de Torres og hendes mand, kaptajn Juan Bautista Panduro. På stedet var broderskabet mellem Vor Frue af ensomhed og den hellige grav, der besatte et kapel dedikeret til San Francisco Xavier. San Diego tempel og skole, arbejde fra århundrede XVII; den første med en meget ædru facade, der allerede synes at tilhøre den neoklassiske stil, og den anden med en smuk arkade, der pryder sin gamle kloster.
Kirken Jesús María, knyttet til klosteret med samme navn, blev grundlagt i 1722; den bevarer stadig sine barokke facader, hvor man kan se store skulpturer, der repræsenterer Sagrada Familia, Virgen de la Luz, San Francisco og Santo Domingo.
Endelig er det vigtigt at fremhæve yderligere tre religiøse konstruktioner, der er fremkommet som de bedste eksempler, hver for sig, på udviklingen af kolonial arkitektur i Guadalajara, hovedsageligt mellem det syttende og det attende århundrede. Således har vi Aránzazu-kapellet fra midten af det 18. århundrede med dets nysgerrige klokketårn og dets interiør dekoreret med storslåede malerier og Churrigueresque altertavler fra samme periode og betragtes som de bedste i byen. Klostret og kirken Santa Mónica, grundlagt af fader Feliciano Pimentel i første halvdel af det 18. århundrede; dens tempel udviser en dobbelt facade med rig udsmykning klassificeret som det bedste eksempel på den sprudlende soloniske barokstil. Templet San Felipe Neri, bygget i 1766 af arkitekten Pedro Ciprés, danner et sæt ekstraordinær ædruelighed, der inkorporerer elementer med platereske erindringer i sin udsmykning, et aspekt der placerer templet som den bedste religiøse bygning i Guadalajara.
I de konstruktioner, der svarer til civil arkitektur, er der nogle beundringsværdige bygninger, blandt hvilke vi kan nævne regeringspaladset, gamle kongehuse, der blev modificeret i det 18. århundrede efter et projekt af militæringeniøren Juan Francisco Espino, selvom facaden var arbejde af Miguel José Conique. Bygningen blev i det væsentlige udtænkt i barokstil, men visse neoklassiske tendenser er allerede mærkbare i den. De kongelige kontorer, som var i den nedlagte Palacio de Medrano, og publikumslokalerne fungerede på stedet.
Vi har også det, der var Conciliar Seminary dedikeret til San José, indviet af biskop Galindo y Chávez i 1701, i dag besat af Regionalmuseet i Guadalajara med sin hovedkloster af søjler i toscansk stil og dens barokke døråbninger. Den berømte Hospicio Cabañas bygget i begyndelsen af det 19. århundrede efter planerne fra den berømte arkitekt Manuel Tolsá, ledet værket José Gutiérrez og afsluttet år senere af arkitekten Gómez Ibarra, og som udgør et bemærkelsesværdigt eksempel på den neoklassiske stil.
Blandt andre mindre konstruktioner, der tilvejebragte stilenhed til byen Guadalajara, kan vi nævne, skønt ikke alle er bevarede: det statelige palæ fra det 16. århundrede, der stod foran det, der engang var San Sebastián-pladsen i Analco-kvarteret. Huset på Calle de la Alhóndiga nr. 114, i øjeblikket Pino Suárez. De boliger, der tilhørte Sánchez Leñero-familien på nr. 37 og Mr. Dionisio Rodríguez på nr. 133 på Calle de Alcalde. Calderón-huset, en traditionel koloniboks, der blev grundlagt i 1729 og ligger på hjørnet af de gamle gader i Santa Teresa og Santuario, i dag Morelos og Pedro Loza; den fra Francisco Velarde, i en nyklassicistisk stil og til sidst den, der var Cañedo-palæet, der ligger foran bagsiden af katedralen.
I nærheden af Guadalajara, den tredje vigtigste by i landet, er den gamle bydel i San Juan Bautista Melzquititlán, i dag San Juan de los Lagos. Denne by er blevet et vigtigt religiøst centrum på grund af den store mirakuløse tradition for billedet af Jomfru Maria, der bevarer sin basilika, bygget i midten af det 17. århundrede af Don Juan Rodríguez Estrada. I samme by kan du se andre konstruktioner såsom templet for den tredje orden, Golgata kapel, kapellet for det første mirakel, der stammer fra det 17. og 18. århundrede. Der er også vigtige civile bygninger i befolkningen, såsom kollegiets palads og tiendebygningen, blandt andre.
I byen Lagos de Moreno kan du se dets vigtigste sogn, et værk fra det 17. århundrede med en smuk facade i Churrigueresque-stil.
Endelig er der i San Pedro Tlaquepaque nogle eksempler på barok religiøs arkitektur i regionen, såsom San Pedro sogn og Soledad-templet.
